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Deltacron n'est pas une nouvelle souche ou variante

Deltacron n'est pas une nouvelle souche ou variante mais un cas de co-infection avec deux variantes du SRAS-CoV-2. Au cours des deux dernières années, différentes variantes de la souche SARS CoV-2 sont apparues avec un degré variable d'infectiosité et de gravité de la maladie. Des variantes telles que delta et omicron commencent à provoquer une co-infection, ce qui a conduit à des reportages dans les médias les étiquetant comme différentes souches du virus. Cependant, cela est trompeur car il s'agit simplement d'une infection causée par une combinaison de deux variantes, explique Rajeev Soni, un éminent biologiste moléculaire et biotechnologue. 

La pandémie de COVID-19 causée par la souche du virus corona SARS CoV-2 a paralysé le monde entier au cours des deux dernières années, ralentissant les économies et mettant un terme à la vie normale. À mesure que le virus infecte plus d'individus, de nouvelles variantes apparaissent1 due à des mutations du code génétique. De nouvelles variantes dans le cas de la souche du virus SARS-CoV-2 émergent en raison de mutations, principalement dans le domaine de liaison au récepteur (RBD) de la protéine de pointe. De plus, des délétions de régions au sein des protéines de pointe ont également été rapportées. La pire des variantes a été la variante delta qui a provoqué une augmentation des infections à COVID dans le monde entier, ainsi qu'une augmentation de la mortalité. Récemment, en novembre 2021, l'Afrique du Sud a signalé une autre variante appelée Omicron, qui est 4 à 6 fois plus infectieuse que la variante delta, bien que causant une maladie moins grave. Une autre variante appelée la variante IHU2 a été identifié en France au cours des deux dernières semaines.  

De plus, il y a eu des rapports de co-infection de personnes avec les différents variantes, par exemple delta et omicron. Que nous appelions l'infection Delmicron ou Deltacron, une chose importante à garder à l'esprit est que ces termes font référence à l'infection causée par une combinaison de « deux variantes du même souche du virus, le SRAS CoV-2″, et à ne pas confondre avec différentes « souches », explique le Dr Rajeev Soni, biologiste moléculaire et biotechnologue accompli et ancien élève de l'Université de Cambridge, au Royaume-Uni. 

Appeler la co-infection avec différentes variantes, une souche différente de virus est trompeur. Une souche est généralement qualifiée de très différente en termes de propriétés biologiques et de comportement, ce qui n'est certainement pas le cas des variantes observées jusqu'à présent.3. Une autre co-infection qui a été signalée est celle avec la souche du virus de la grippe et la souche du virus corona nommant l'infection Flurona. Cela ne fait pas du tout de Flurona une variété différente. 

Dans les prochains jours, d'autres variantes apparaîtront, ce qui pourrait entraîner davantage de co-infections. Cependant, ceux-ci ne doivent pas être qualifiés de souches différentes du virus. La nomenclature ne doit être limitée qu'à la maladie causée par l'infection des variants impliqués. 

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Bibliographie 

  1. Bessière P, Volmer R (2021) De un à plusieurs : L'augmentation intra-hôte des variants viraux. Pathog PLoS 17(9) : e1009811. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1009811  
  1. Nouvelle variante 'IHU' (B.1.640.2) détectée en France. Scientific European Publié le 04 janvier 2022. Disponible sur http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/new-ihu-variant-b-1-640-2-detected-in-france/  
  1. COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK). Explication - Qu'entendent les virologues par « mutation », « variante » et « souche » ? 3 mars 2021. Disponible sur https://www.cogconsortium.uk/what-do-virologists-mean-by-mutation-variant-and-strain/ 

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Équipe SCIEU
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