La durée du test est considérablement réduite, passant d'environ une heure à quelques minutes, grâce à la nouvelle méthode RTF-EXPAR qui utilise une approche sans transcriptase inverse (RTF) pour la conversion de l'ARN en ADN, suivie d'une réaction d'amplification exponentielle (EXPAR) pour l'amplification à une température unique.
Pour maîtriser la propagation de la COVID-19, il est indispensable de disposer d'une stratégie de dépistage rapide et précise. La RT-PCR (réaction en chaîne par polymérase après transcription inverse), la méthode de dépistage la plus précise actuellement utilisée, est un test en deux étapes qui prend environ 60 minutes par échantillon.
Les chercheurs de l'Université de Birmingham ont signalé une nouvelle méthode de détection du SRAS-CoV-2. Cela pourrait permettre des tests beaucoup plus rapides et est suffisamment sensible.
La détection de l'ARN viral par RT-PCR (réaction en chaîne par polymérase après transcription inverse) repose sur la conversion de l'ARN viral en ADN complémentaire (ADNc), suivie de l'amplification de l'ADNc par PCR quantitative (qPCR). L'ADNc est ensuite détecté à l'aide d'un colorant fluorescent. Cette procédure peut durer jusqu'à une heure.
La durée de l'analyse est considérablement réduite, passant d'environ une heure à quelques minutes, grâce à la nouvelle méthode RTF-EXPAR. Cette méthode utilise une approche sans transcriptase inverse (RTF) pour la conversion de l'ARN en ADN, suivie d'une réaction d'amplification exponentielle (EXPAR) à température unique. L'amplification à température unique est essentielle à la rapidité de l'opération, car elle évite les longues étapes de chauffage et de refroidissement de la RT-PCR. De plus, la portion d'ADN amplifiée est plus petite qu'en RT-PCR. Ainsi, l'EXPAR génère jusqu'à 108⁸ brins d'ADN en quelques minutes. La formation du duplex est suivie, comme en RT-PCR, grâce au colorant fluorescent SYBR Green.
Fait intéressant, la nouvelle méthode peut être modifiée pour détecter plusieurs autres maladies infectieuses causées par des virus à ARN, par exemple Ebola, RSV, etc.
Source (s):
Carter et al. (2020). Détection de l'ARN du SARS-CoV-2 en moins de 5 minutes par une réaction d'amplification exponentielle sans transcriptase inverse (RTF-EXPAR). Prépublication. Disponible sur medRxiv depuis le 04 janvier 2021. DOI : https://doi.org/10.1101/2020.12.31.20248236
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