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B.1.617 Variante du SRAS COV-2 : virulence et implications pour les vaccins

COVID-19B.1.617 Variante du SRAS COV-2 : virulence et implications pour les vaccins

La variante B.1.617 qui a provoqué la récente crise du COVID-19 en Inde a été impliquée dans une transmission accrue de la maladie au sein de la population et pose un défi important en ce qui concerne la gravité de la maladie et l'efficacité des vaccins actuellement disponibles. 

Le COVID-19 a causé des dommages sans précédent dans le monde entier, tant sur le plan social qu'économique. Certains pays ont également connu les deuxième et troisième vagues. Il y a eu une augmentation récente du nombre de cas en Inde, qui a maintenant connu une moyenne de trois à quatre cent mille cas chaque jour au cours du dernier mois environ. Nous avons récemment analysé ce qui a pu mal tourner avec la crise du COVID en Inde1. Outre les facteurs sociaux et culturels qui ont pu conduire à la recrudescence, le virus lui-même a muté d'une telle manière qui a conduit à l'émergence d'une variante qui est plus contagieuse qu'auparavant. Cet article décrit comment la nouvelle variante a pu émerger, son potentiel de maladie et ses implications pour l'efficacité du vaccin et les mesures qui peuvent être prises à l'avenir pour réduire son impact au niveau local et mondial et empêcher l'émergence de nouvelles variantes. 

B.1.617 variante est apparu pour la première fois en octobre 2020 dans l'État du Maharashtra et s'est depuis propagé à environ 40 pays, dont le Royaume-Uni, les Fidji et Singapour. Au cours des derniers mois, la souche est devenue une souche dominante dans toute l'Inde et, en particulier au cours des 4 à 6 dernières semaines, a été responsable d'une énorme augmentation des taux d'infection. Le B.1.617 a huit mutations dont 3 mutations à savoir L452R, E484Q et P681R sont les principales. L452R et E484Q sont tous deux dans le domaine de liaison au récepteur (RBD) et sont responsables non seulement de l'augmentation de la liaison au récepteur ACE22 entraînant une transmissibilité accrue, mais jouent également un rôle dans la neutralisation des anticorps3. La mutation P681R augmente de manière significative la formation de syncytium, qui contribue potentiellement à une pathogenèse accrue. Cette mutation provoque la fusion des cellules virales, créant un espace plus grand pour la réplication du virus et rendant difficile la destruction des anticorps. En plus de B.1.617, deux autres souches peuvent également avoir été responsables de l'augmentation des taux d'infection, B.1.1.7 à Delhi et au Pendjab et B.1.618 au Bengale occidental. La souche B.1.1.7 a été identifiée pour la première fois au Royaume-Uni dans la seconde moitié de 2020 et porte la mutation N501Y dans RBD, qui a conduit à sa transmissibilité accrue par une liaison améliorée au récepteur ACE24. De plus, il présente d'autres mutations, dont deux délétions. B.1.1.7 s'est jusqu'à présent répandu dans le monde et a acquis la mutation E484R au Royaume-Uni et aux États-Unis. Il a été démontré que le mutant E484R a une sensibilité 6 fois plus faible aux sérums immuns d'individus vaccinés avec le vaccin à ARNm de Pfizer et une sensibilité 11 fois plus faible aux sérums de convalescents.5

La nouvelle souche de virus avec des mutations ajoutées ne peut émerger que lorsque le virus infecte les hôtes et subit une réplication. Cela conduit à la génération de variantes plus « plus en forme » et infectieuses. Cela aurait pu être évité en empêchant la transmission humaine en respectant les protocoles de sécurité tels que la distanciation sociale, l'utilisation appropriée de masques dans les lieux publics/surpeuplés et en suivant les directives d'hygiène personnelle de base. L'émergence et la propagation de B.1.617 suggèrent que ces directives de sécurité peuvent ne pas avoir été strictement suivies.  

La souche B.1.617 qui a fait des ravages en Inde, a été classée par l'Organisation mondiale de la santé (OMS) comme la « variante préoccupante (COV) ». Cette classification est basée sur une transmissibilité et une propagation accrues de la maladie grave par le variant.  

Il a été démontré que la souche B.1.617 provoque une inflammation plus forte dans des études animales utilisant des hamsters que toute autre variante6. De plus, cette variante est entrée par une efficacité accrue dans les lignées cellulaires in vitro et ne s'est pas liée au Bamlanivimab, un anticorps utilisé pour le traitement COVID-197. Des études menées par Gupta et ses collègues ont montré que bien que les anticorps neutralisants générés par les individus vaccinés à l'aide du vaccin de Pfizer soient environ 80 % moins puissants contre certaines des mutations de B.1.617, cela ne rendrait pas la vaccination inefficace.3. Ces chercheurs ont également découvert que certains agents de santé de Delhi qui avaient été vaccinés avec Covishield (vaccin Oxford-AstraZeneca) avaient été réinfectés par la souche B.1.617. Études supplémentaires par Stefan Pohlmann et ses collègues7 en utilisant du sérum de personnes qui avaient déjà été infectées par le SRAS-CoV-2, a constaté que leurs anticorps neutralisaient B.1.617 environ 50 % moins efficacement que les souches circulant auparavant. Lorsque le sérum a été testé sur des participants qui avaient reçu deux injections du vaccin Pfizer, il a révélé que les anticorps étaient environ 67 % moins puissants contre B.1.617. 

Bien que les études ci-dessus indiquent que le B.1.617 a un avantage sur les autres souches du virus en termes de transmissibilité plus élevée et d'évitement des anticorps neutralisants dans une certaine mesure sur la base d'études d'anticorps sériques, la situation réelle dans le corps peut être différente en raison au grand nombre d'anticorps produits et aussi au fait que d'autres parties du système immunitaire telles que les cellules T peuvent ne pas être affectées par les mutations de la souche. Cela a été démontré par la variante B.1.351 qui a été liée à une énorme baisse de la puissance des anticorps neutralisants, mais des études humaines indiquent que les vaccins sont toujours efficaces pour prévenir les maladies graves. De plus, des études utilisant Covaxin ont également montré que ce vaccin continue d'être efficace8, bien qu'il y ait eu une petite baisse de l'efficacité des anticorps neutralisants générés par le vaccin Covaxin. 

Toutes les données ci-dessus suggèrent que davantage de recherches sont nécessaires pour comprendre l'efficacité des vaccins actuels et la génération de futures versions basées sur l'émergence de nouvelles souches qui pourraient tenter d'échapper au système immunitaire à leur propre avantage. Néanmoins, les vaccins actuels continuent d'être efficaces (même s'ils ne sont peut-être pas à 100 %), afin de prévenir les maladies graves et le monde devrait s'efforcer de procéder à une vaccination de masse le plus tôt possible tout en gardant un œil sur les souches émergentes afin de prendre les mesures nécessaires. et des mesures appropriées au plus tôt. Cela garantirait que la vie peut revenir à la normale le plus tôt possible. 

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Références:  

  1. Soni R. 2021. Crise COVID-19 en Inde : ce qui a pu mal tourner. Scientifique européen. Publié le 4 mai 2021. Disponible en ligne sur https://www.scientificeuropean.co.uk/covid-19/covid-19-crisis-in-india-what-may-have-gone-wrong/ 
  1. Chérian S et al. 2021. Évolution convergente des mutations de pointe du SRAS-CoV-2, L452R, E484Q et P681R, dans la deuxième vague de COVID-19 à Maharashtra, en Inde. Préimpression à bioRxiv. Publié le 03 mai 2021. DOI : https://doi.org/10.1101/2021.04.22.440932   
  1. Ferreira I., Datir R., et al 2021. SARS-CoV-2 B.1.617 émergence et sensibilité aux anticorps induits par le vaccin. Préimpression. BioRxiv. Publié le 09 mai 2021. DOI : https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.05.08.443253v1  
  1. Gupta R K. 2021. Les variantes préoccupantes du SRAS-CoV-2 affecteront-elles la promesse des vaccins ?. Nat Rev Immunol. Publié : 29 avril 2021. DOI : https://doi.org/10.1038/s41577-021-00556-5 
  1. Collier DA et al. 2021. Sensibilité du SARS-CoV-2 B.1.1.7 aux anticorps provoqués par le vaccin à ARNm. Nature https://doi.org/10.1038/s41586-021-03412-7
  1. Yadav PD et al. 2021. La variante B.2 du SRAS CoV-1.617.1 est hautement pathogène chez les hamsters par rapport à la variante B.1. Préimpression à bioRxiv. Publié le 05 mai 2021. DOI : https://doi.org/10.1101/2021.05.05.442760   
  1. Hoffman M et al. 2021. La variante B.2 du SRAS-CoV-1.617 est résistante au Bamlanivimab et échappe aux anticorps induits par l'infection et la vaccination. Publié le 05 mai 2021. Préimpression sur bioRxiv. EST CE QUE JE: https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442663   
  1. Yadav PD et al. 2021. Neutralisation du variant à l'étude B.1.617 avec des sérums de vaccinés BBV152. Publié: 07 mai 2021. Clin. Infecter. Dis. EST CE QUE JE: https://doi.org/10.1093/cid/ciab411   

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Rajeev Soni
Rajeev Sonihttps://www.RajeevSoni.org/
Le Dr Rajeev Soni (ID ORCID : 0000-0001-7126-5864) est titulaire d'un doctorat. en biotechnologie de l'Université de Cambridge, Royaume-Uni et a 25 ans d'expérience de travail à travers le monde dans divers instituts et multinationales tels que The Scripps Research Institute, Novartis, Novozymes, Ranbaxy, Biocon, Biomerieux et en tant que chercheur principal avec US Naval Research Lab dans la découverte de médicaments, le diagnostic moléculaire, l'expression de protéines, la fabrication de produits biologiques et le développement commercial.

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