Le temps de dosage est considérablement réduit d'environ une heure à quelques minutes par la nouvelle méthode RTF-EXPAR qui utilise une approche sans transcriptase inverse (RTF) pour la conversion de l'ARN en ADN suivie d'EXPAR (réaction d'amplification exponentielle) pour l'amplification à une seule température .
Le contrôle du taux de propagation du COVID-19 nécessite une stratégie de test de virus précise et plus rapide. RT-PCR (réaction en chaîne par polymérase de transcriptase inverse), la méthode de test la plus précise actuellement utilisée est un test en deux étapes qui prend environ 60 minutes par échantillon.
Les chercheurs de l'Université de Birmingham ont signalé une nouvelle méthode de détection du SRAS-CoV-2. Cela pourrait permettre des tests beaucoup plus rapides et est suffisamment sensible.
La détection de l'ARN viral par RT-PCR (réaction en chaîne par polymérase de la transcriptase inverse) implique la conversion de l'ARN viral en ADN complémentaire (ADNc) suivie de l'amplification de l'ADNc par une PCR quantitative (qPCR). L'ADNc est ensuite détecté à l'aide d'un colorant fluorescent. Cela prend jusqu'à une heure.
Le temps de dosage est considérablement réduit d'environ une heure à quelques minutes par la nouvelle méthode RTF-EXPAR qui utilise une approche sans transcriptase inverse (RTF) pour la conversion de l'ARN en ADN suivie d'EXPAR (Exponential Amplification Reaction) pour l'amplification à température unique . L'amplification ayant lieu à une seule température est la clé de la rapidité, car elle évite les longues étapes de chauffage et de refroidissement de la RT-PCR. De plus, la section d'ADN amplifiée est plus petite que la RT-PCR. Par conséquent, EXPAR génère jusqu'à 108 brins de produit d'ADN en quelques minutes. La formation de duplex est surveillée, comme dans la méthode RT-PCR utilisant le colorant fluorescent SYBR Green.
Fait intéressant, la nouvelle méthode peut être modifiée pour détecter plusieurs autres maladies infectieuses causées par des virus à ARN, par exemple Ebola, RSV, etc.
Source (s):
Carter et al (2020). Détection en moins de 5 minutes de l'ARN du SRAS-CoV-2 à l'aide d'une réaction d'amplification exponentielle sans transcriptase inverse, RTF-EXPAR. Préimpression. Publié à medRxiv Publié le 04 janvier 2021. DOI : https://doi.org/10.1101/2020.12.31.20248236
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