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Deltamicron : Delta-Omicron recombinant avec des génomes hybrides  

Des cas de co-infections avec deux variantes ont été signalés plus tôt. On ne savait pas grand-chose sur la recombinaison virale produisant des virus avec des génomes hybrides. Deux études récentes rapportent des cas de recombinaison génétique entre les variants du SARS-CoV-2 Denta & Omicron. Le recombinant, appelé Deltamicron, présentait les caractéristiques des deux variantes.  

Le terme 'deltacron' est apparu au début de cette année1 pour désigner les cas de co-infection au COVID-19 de personnes avec les différentes variantes des variantes du SRAS-Cov-2, par exemple delta et omicron. Delmicron ou Deltacron faisaient référence à l'infection provoquée par une combinaison de « deux variantes de la même souche du virus, le SRAS CoV-2″, et ne seraient pas différentes ».souches ».  

Cependant, des cas de recombinaison génétique entre deux souches différentes de SRAS-CoV-2 ont été signalés récemment. Le 08 mars 2022, les chercheurs2 signalé trois infections dans le sud de la France par « Deltamicron » recombinant avec hybride génome qui contenait une protéine de pointe provenant d’une variante Omicron et le « corps » d’une variante Delta. L'hybride génome avait des mutations signature des deux lignées. Le pic recombinant pourrait optimiser la liaison virale à la membrane de la cellule hôte.  

Preuves pour Delta et Omicron la recombinaison est apparue aux États-Unis3 aussi. Cette équipe a pu identifier deux cas indépendants de recombinant Delta-Omicron. Dans les deux cas, l’extrémité 5′ du virus génome était du Delta génome, et l'extrémité 3′ d'Omicron.  

Il est suggéré que les virus recombinants ne sont pas courants et qu'il n'existe aucune preuve suggérant que les recombinants avec des virus hybrides génomes sont plus transmissibles ou virulents que les variantes dominantes en circulation.  

***

Références:  

  1. Deltacron n'est pas une nouvelle souche ou une variante. Scientifique Européen. Publié le 9 janvier 2022. Disponible sur http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/deltacron-is-not-a-new-strain-or-variant/  
  1. Colson, P., et al 2022. Culture et identification d'un SRAS-CoV-2 "deltamicron" dans un cluster de trois cas dans le sud de la France. Prétirage medRxiv. Publié le 08 mars 2022. DOI : https://doi.org/10.1101/2022.03.03.22271812  
  1. Bolzé A., et al 2022. Preuve des co-infections et recombinaisons SARS-CoV-2 Delta et Omicron. Prétirage medRxiv. Publié le 12 mars 2022. DOI : https://doi.org/10.1101/2022.03.09.22272113 

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Équipe SCIEU
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