L'origine naturelle du SARS-CoV-2 reste incertaine, aucun hôte intermédiaire transmettant le virus des chauves-souris à l'homme n'ayant été identifié à ce jour. En revanche, certains éléments indirects suggèrent une origine en laboratoire, notamment le fait que des recherches sur le gain de fonction (induisant des mutations artificielles du virus par passages répétés dans des lignées cellulaires humaines) étaient menées en laboratoire.
La COVID-19, maladie causée par le virus SARS-CoV-2 , a engendré des dommages sans précédent à l' échelle planétaire , non seulement sur le plan économique, mais aussi sur le plan psychologique, avec des répercussions qui mettront longtemps à se résorber. Depuis son apparition à Wuhan en novembre/décembre 2019, plusieurs théories ont été avancées quant à son origine. La plus répandue évoque le marché de Wuhan , où le virus aurait franchi la barrière des espèces, passant des chauves-souris à l'homme par l'intermédiaire d'un hôte intermédiaire, en raison de sa transmission zoonotique, comme cela a été observé pour le SRAS (des chauves-souris aux civettes, puis à l'homme) et le MERS (des chauves-souris aux chameaux, puis à l'homme) <sup> 1,2 </sup>. Cependant, depuis environ un an, l'hôte intermédiaire du SARS- CoV -2 reste inconnu . Une autre théorie fait état d'une fuite accidentelle du virus depuis l'Institut de virologie de Wuhan (IVW), où des scientifiques menaient des recherches sur les coronavirus. Pour comprendre pourquoi cette dernière théorie a gagné en popularité au cours de l'année écoulée, il faut revenir sur les événements du passé récent, à partir de 2011, afin d'examiner la nature et l'origine de ces coronavirus susceptibles de provoquer des maladies chez l'homme.
En 2012, six mineurs travaillant dans une mine de cuivre infestée de chauves-souris dans le sud de la Chine (province du Yunnan) ont été infectés par un coronavirus de chauve- souris , le RaTG13. Tous ont développé des symptômes identiques à ceux de la COVID-19 et seuls trois ont survécu. Des échantillons viraux ont été prélevés sur ces mineurs et envoyés à l'Institut de virologie de Wuhan (IVW), le seul laboratoire de biosécurité de niveau 4 en Chine étudiant les coronavirus de chauve-souris . Shi Zheng-Li et ses collègues de l'IVW étudient les virus SARS-CoV provenant de chauves-souris afin de mieux comprendre l'origine de ces coronavirus . L' IVW aurait mené des recherches sur le gain de fonction , impliquant des passages successifs de ces virus in vitro et in vivo dans le but d'accroître leur pathogénicité, leur transmissibilité et leur antigénicité. Ces recherches sur le gain de fonction sont très différentes de la modification génétique des virus pour les rendre plus mortels. L'idée qui sous-tend le financement et la réalisation de recherches sur le gain de fonction est de garder une longueur d'avance sur les virus afin de comprendre leur infectiosité chez l'homme et ainsi mieux préparer l'humanité si une telle éventualité venait à se produire.
Ainsi, il est probable que le virus SARS-CoV-2 se soit échappé accidentellement lorsqu'il est apparu fin 2019 à Wuhan, bien qu'aucune preuve concrète ne le confirme. Le virus le plus proche de ce virus est le RaTG13, isolé chez des mineurs du Yunnan. Le RaTG13 n'est pas à la base du SARS-CoV-2, réfutant ainsi la théorie d' une manipulation génétique de ce dernier. Cependant, l'échantillonnage de virus apparentés au SARS à des fins de recherche, et les recherches ultérieures visant à obtenir des mutations induites, ont peut-être contribué au développement du SARS-CoV-2. L'obtention de fonctions ne requiert pas de manipulation génétique. Le séquençage du génome du nouveau virus , isolé chez les cinq premiers patients atteints de la COVID-19, a révélé une identité de 79.6 % avec le virus du SARS-CoV -6.
Au départ, la communauté scientifique pensait que le virus SARS-CoV-2 avait franchi la barrière des espèces (chauves-souris) pour se transmettre à un hôte intermédiaire, puis à l'homme <sup>7 </sup> , comme ce fut le cas pour les virus du SRAS et du MERS , mentionnés précédemment. Cependant, l'absence d'hôte intermédiaire identifié au cours des 18 derniers mois a alimenté la théorie du complot<sup> 8</sup> selon laquelle le virus aurait pu se propager accidentellement depuis un laboratoire. Il est également possible que le virus SARS-CoV-2 provienne de la collection de virus déjà conservée à l'Institut de virologie de Wuhan (WIV)<sup> 9 </sup>, car il était déjà bien adapté à l'infection des cellules humaines. S'il avait été d'origine naturelle, il lui aurait fallu un certain temps pour atteindre le niveau de transmissibilité et de létalité observé.
L'origine du SARS-CoV-2 reste incertaine : est-il naturel ou a-t-il été créé par l'homme (par gain de fonction induisant des mutations artificielles) et s'est-il échappé accidentellement d'un laboratoire ? Aucune preuve tangible ne permet de privilégier l'une ou l'autre de ces hypothèses. Toutefois, l'absence d'hôte intermédiaire pour la transmission zoonotique de ce virus , son adaptation déjà remarquable à l'infection des cellules humaines et les recherches menées à l'Institut de virologie de Wuhan (WIV), son lieu d' origine, suggèrent qu'il s'agit d'un produit issu de recherches sur le gain de fonction et ayant échappé au laboratoire.
Des preuves et des enquêtes supplémentaires sont nécessaires pour établir une preuve concluante, non seulement pour comprendre l'origine du virus SARS-CoV-2 , mais aussi pour atténuer tout accident de ce type qui pourrait survenir à l'avenir, afin de préserver l'humanité de la violence de tels virus.
***
Références
- Liu, L., Wang, T. & Lu, J. La prévalence, l'origine et la prévention de six coronavirus humains. virole. Péché. 31 94 – 99 (2016). https://doi.org/10.1007/s12250-015-3687-z
- Shi, ZL., Guo, D. & Rottier, PJM Coronavirus : épidémiologie, réplication du génome et interactions avec leurs hôtes. virole. Péché. 31 1 – 2 (2016). https://doi.org/10.1007/s12250-016-3746-0
- Ge, XY., Wang, N., Zhang, W. et al. Coexistence de plusieurs coronavirus dans plusieurs colonies de chauves-souris dans un puits de mine abandonné. virole. Péché. 31 31 – 40 (2016). https://doi.org/10.1007/s12250-016-3713-9
- Hu B, Zeng LP, Yang XL, Ge XY, Zhang W, Li B, Xie JZ, Shen XR, Zhang YZ, Wang N, Luo DS, Zheng XS, Wang MN, Daszak P, Wang LF, Cui J, Shi ZL . La découverte d'un riche pool génétique de coronavirus de chauve-souris liés au SRAS fournit de nouvelles informations sur l'origine du coronavirus du SRAS. Pathog PLoS. 2017 novembre 30 ; 13 (11) : e1006698. est ce que je: https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1006698. PMID : 29190287 ; PMCID : PMC5708621.
- Vineet D. Menachery et al, "Un groupe de coronavirus de chauve-souris circulant de type SRAS montre un potentiel d'émergence humaine", Nat Med. Déc 2015 ; 21(12):1508-13. EST CE QUE JE: https://doi.org/10.1038/nm.3985.
- Zhou, P., Yang, XL., Wang, XG. et al. Une épidémie de pneumonie associée à un nouveau coronavirus d'origine probable de chauve-souris. Nature 579 270-273 (2020). EST CE QUE JE: https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7
- Calisher C, Carroll D, Colwell R, Corley RB, Daszak P et al. Déclaration de soutien aux scientifiques, aux professionnels de la santé publique et aux professionnels de la santé de Chine dans la lutte contre le COVID-19. VOLUME 395, NUMÉRO 10226, E42-E43, 07 MARS 2020 DOI : https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30418-9
- Rasmussen, AL Sur les origines du SRAS-CoV-2. Nat Med 27 9 (2021). https://doi.org/10.1038/s41591-020-01205-5.
- Institut de virologie de Wuhan, CAS, « Jetez un œil à la plus grande banque de virus d'Asie », 2018, disponible à l'adresse http://institute.wuhanvirology.org/ne/201806/t20180604_193863.html
***
Félicitations au Dr Rajeev Soni pour cet article bien documenté et bien articulé sur les origines du SRAS-CoV-2. Vous avez apporté une nouvelle perspective à ce débat houleux. Votre théorie selon laquelle la recherche sur le gain de fonction aboutirait à des mutations induites artificiellement et à la fuite d'une de ces souches est non seulement plausible, mais semble également crédible.
Article très bien articulé Dr Rajeev avec une approche scientifique et basée sur la recherche.
Donne un bon aperçu et est analysé de manière très méthodique.
Merci Sandeep pour votre avis. Cependant, la théorie du gain de fonction est bien connue depuis des années et ma mention dans l'article indique que ces recherches étaient menées au laboratoire de l'Institut de virologie de l'Université de Virginie.
Merci Atul pour vos commentaires.
Waouh… Un article très pertinent et bien documenté, très instructif. Au milieu de toutes ces théories du complot qui circulent, c'est tellement rafraîchissant de lire un point de vue différent. Une approche positive et apparemment authentique des origines du SRAS-CoV-2. Vraiment appréciable !
Merci Navjeet. Content que ça vous ait plu.