Génétique du COVID-19 : pourquoi certaines personnes développent des symptômes graves

L’âge avancé et les comorbidités sont connus pour être des facteurs de risque élevés de COVID-19. La constitution génétique prédispose-t-elle certaines personnes, les rendant plus sensibles aux symptômes graves ? À l'inverse, la constitution génétique permet-elle à certaines personnes d'avoir une immunité innée les rendant immunisées contre le COVID-19, ce qui implique que ces personnes peuvent ne pas avoir besoin de vaccins. L'identification des personnes présentant une susceptibilité génétique (au moyen de l'analyse du génome) peut fournir une approche de médecine personnalisée/de précision plus efficace pour lutter contre cette pandémie et d'autres maladies lourdes comme le cancer.  

COVID-19 est connu pour affecter de manière disproportionnée les personnes âgées et les personnes souffrant de comorbidités, mais il semble y avoir un autre modèle. Apparemment, certaines personnes sont génétiquement plus sujettes et prédisposées à développer des symptômes graves mettant leur vie en danger ¹ comme indiqué dans les cas signalés comme trois frères du même groupe d'âge (qui vivaient séparément et étaient en bonne santé) succombant à COVID-19 ². Ce petit groupe de personnes souffre d'hyperinflammation, de détérioration clinique et de défaillance de plusieurs organes dus au développement Tempête de cytokines (CS) dans lequel l'interleukine-6 ​​(IL-6) est un médiateur central. Deux polymorphismes génétiques courants qui prédisposent à l'hyperinflammation sont la fièvre méditerranéenne familiale (FMF) et le déficit en glucose-6-phosphate déshydrogénase (G6PD) qui, combiné à l'obésité, augmente encore le risque. ³.  

Une revue systématique établit un lien entre la susceptibilité et les variantes génétiques des gènes de réponse immunitaire. Quarante gènes se sont avérés être associés à la susceptibilité et 21 de ces gènes avaient une relation avec le développement de symptômes graves ⁴. Une autre étude soutient l'opinion selon laquelle gène ACE2 le polymorphisme contribue à la susceptibilité au COVID-19 ⁵. Le virus responsable du COVID-19 utilise la protéine réceptrice de l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) présente à la surface cellulaire pour pénétrer dans la cellule. Toute variation du gène ACE2 aurait une forte incidence sur la prédisposition au COVID. Le rôle de la génétique de l'hôte dans la susceptibilité au COVID-19 est étudié au niveau des variantes structurelles (SV) dans une étude rapportée en prépublication récemment par Sahajpal NS, et al. Dans cette étude, les chercheurs ont effectué une analyse du génome de 37 patients COVID-19 gravement malades. Cette enquête centrée sur le patient a identifié 11 grandes variantes structurelles impliquant 38 gènes avec un rôle potentiel dans le développement de symptômes graves de COVID-19 ⁶. 

La base de connaissances en évolution rapide sur le rôle de la génétique de l'hôte dans COVID-19 la progression de la maladie peut indiquer un changement d'orientation approprié vers une approche ciblée de la prévention et du traitement du COVID-19. Il peut être possible de penser à des interventions ciblées avec précision sur la constitution génétique unique des individus ⁷. Les traitements ou interventions personnalisés et précis nécessiteraient cependant des données d'analyse du génome au niveau individuel. Il peut y avoir un problème de confidentialité à traiter, mais à long terme, cela peut également s'avérer plus efficace du point de vue des coûts.  

À l'heure actuelle, certaines organisations commerciales fournissent des services personnels couvrant les prédispositions de base en matière de santé des individus. Cependant, des efforts plus organisés dans le secteur public seraient nécessaires pour construire la base de connaissances et l'infrastructure pour que la médecine de précision personnalisée soit une réalité. Étude multicentrique GEN-COVID ⁸ qui visent à dériver des données phénotypiques et génotypiques au niveau individuel par le biais de biobanques et de dossiers de santé pour mettre les données à la disposition de COVID-19 chercheurs du monde entier est un pas en avant dans cette direction.  

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Références:  

1. Kaiser J., 2020. À quel point le coronavirus vous rendra-t-il malade ? La réponse est peut-être dans vos gènes. Science. Publié le 27 mars 2020. DOI : https://doi.org/10.1126/science.abb9192 

2. Yousefzadegan S. et Rezaei N., 2020. Rapport de cas : Décès dû au COVID-19 chez Three Brothers. Le Journal américain de médecine tropicale et d'hygiène. Volume 102 : Numéro 6 Page(s) : 1203-1204. Publié en ligne : 10 avril 2020. DOI : https://doi.org/10.4269/ajtmh.20-0240 

3. Woo Y., Kamarulzaman A., et al 2020. Une prédisposition génétique pour Cytokine Storm dans l'infection COVID-19 potentiellement mortelle. OSFPreprints. Création : 12 avril 2020. DOI : https://doi.org/10.31219/osf.io/mxsvw    

4. Elhabyan A., Elyaacoub S., et al, 2020. Le rôle de la génétique de l'hôte dans la susceptibilité aux infections virales sévères chez l'homme et un aperçu de la génétique de l'hôte de COVID-19 sévère: Une revue systématique, Virus Research, Volume 289, 2020. Disponible en ligne le 9 septembre 2020. DOI : https://doi.org/10.1016/j.virusres.2020.198163 

5. Calcagnile M. et Forgez P., 2020. La simulation d'amarrage moléculaire révèle des polymorphismes ACE2 qui peuvent augmenter l'affinité de ACE2 avec la protéine Spike SARS-CoV-2. Biochimie Volume 180, Janvier 2021, Pages 143-148. Disponible en ligne le 9 novembre 2020. DOI : https://doi.org/10.1016/j.biochi.2020.11.004   

6. Sahajpal NS, Lai CJ, et al 2021. L'analyse du génome de l'hôte des variations structurelles par cartographie optique du génome fournit des informations cliniquement précieuses sur les gènes impliqués dans les voies immunitaires, virales et de réplication virales critiques chez les patients atteints de COVID-19 sévère. Préimpression medRxiv. 8 janvier 2021. DOI : https://doi.org/10.1101/2021.01.05.21249190 

7. Zhou, A., Sabatello, M., Eyal, G. et al. La médecine de précision est-elle pertinente à l'ère du COVID-19 ? Genet Med (2021). Publication : 13 janvier 202. DOI :  https://doi.org/10.1038/s41436-020-01088-4 

8. Daga, S., Fallerini, C., Baldassarri, M. et al. Utiliser une approche systématique de la biobanque et analyser les données cliniques et génétiques pour faire avancer la recherche sur le COVID-19. Eur J Hum Genet (2021). Publication : 17 janvier 2021.  https://doi.org/10.1038/s41431-020-00793-7  

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