Kākāpō Parrot : les avantages du séquençage génomique Programme de conservation

Le kākāpō (aussi appelé « perroquet -hibou » en raison de son visage ressemblant à celui d'un hibou) est une espèce de perroquet en danger critique d'extinction, originaire de Nouvelle-Zélande . C'est un animal exceptionnel, car il compte parmi les oiseaux les plus longévifs au monde (il peut vivre jusqu'à 90 ans). Pesant environ 3 à 4 kg, il est également le perroquet le plus lourd, le seul incapable de voler et nocturne au monde.

https://youtu.be/X3J6YaEc9zo?list=TLGG8G5rC5D_iW8yOTA4MjAyMw

Les kākāpō peuplent la Nouvelle-Zélande depuis leur évolution en isolement , mais leur population a rapidement décliné. Dans les années 1970, on ne recensait plus que 18 kākāpō mâles. L'existence de femelles a été confirmée en 1980. Grâce à une gestion intensive de la conservation, les kākāpō ont été sauvés de l'extinction. Leur nombre était de 51 en 1995. Aujourd'hui, on compte 247 kākāpō<sup> 1,2</sup>.

Afin de contribuer à la conservation, le projet Kākāpō125+ a été lancé en 2015 pour séquencer le génome de 125 kākāpō vivants, ainsi que celui de quelques individus importants récemment décédés. L’objectif était d’améliorer la gestion génétique des kākāpō, notamment pour lutter contre la faible fertilité et les maladies qui freinaient leur rétablissement. L’assemblage complet, au niveau chromosomique, du génome de référence d’un kākāpō a été achevé en 2018³.

Dans une étude publiée le 29 août 2023, l'équipe de recherche a rapporté le séquençage du génome de la quasi-totalité de la population de kākāpō (données de 2018), soit 169 individus, à partir de 125 individus vivants et de 44 échantillons conservés. Ces données à l'échelle de la population associent la diversité génétique de l'espèce à des séquences d'ADN spécifiques liées à des caractéristiques telles que la sensibilité aux maladies, la croissance des poussins, etc. Ceci pourrait permettre d'identifier plus précocement les risques sanitaires afin de planifier des traitements personnalisés pour chaque kākāpō. Cette approche, qui consiste à identifier des caractéristiques génétiques spécifiques cruciales pour la survie, pourrait être réutilisée pour la gestion de la conservation d'autres espèces menacées <sup>4,5</sup>.

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Références:  

  1. Département de la Conservation. Gouvernement de la Nouvelle-Zélande. Récupération de Kākāpō. Disponible à  https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/ 
  1. Musée d'histoire naturelle. Les kākāpō originaux de Nouvelle-Zélande sont sur le point de disparaître. https://www.nhm.ac.uk/discover/new-zealands-quirky-kakapo-are-pulled-back-from-extinction.html 
  1. Département de la Conservation. Gouvernement de la Nouvelle-Zélande. Séquençage du gène Kākāpō125+ https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/what-we-do/research-for-the-future/kakapo125-gene-sequencing/ 
  1. Université d'Otago 2023. Actualités – Sauver les espèces de l'extinction – le séquençage de haute qualité de la population de kākāpō constitue une avancée décisive dans la compréhension de la génétique clé de la conservation. Disponible à https://www.otago.ac.nz/news/otago0247128.html Consulté le 29 août 2023.  
  1. Guhlin, J., Le Lec, MF, Wold, J. et al. La génomique à l’échelle de l’espèce du kākāpō fournit des outils pour accélérer le rétablissement. Nat Ecol Evol (2023). https://doi.org/10.1038/s41559-023-02165-y  Prépublication sur bioRxiv doi : https://doi.org/10.1101/2022.10.22.513130  

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Umesh Prasad
Umesh Prasad
Umesh Prasad est un chercheur-communicateur qui excelle dans la synthèse d'études primaires évaluées par les pairs en articles de vulgarisation concis, pertinents et rigoureusement documentés. Spécialiste de la vulgarisation scientifique, il est animé par la volonté de rendre la science accessible aux publics non anglophones. Dans cette optique, il a fondé « Scientific European », une plateforme numérique innovante, multilingue et en libre accès. En comblant une lacune cruciale dans la diffusion mondiale des connaissances, Prasad joue un rôle essentiel de conservateur du savoir. Son travail inaugure une nouvelle ère de journalisme scientifique de pointe, mettant les dernières recherches à la portée de tous dans leur langue maternelle.

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