Kākāpō Parrot : les avantages du séquençage génomique Programme de conservation

Perroquet Kākāpō (également connu sous le nom de « chouette perroquet" en raison de ses traits faciaux ressemblant à ceux d'un hibou) est une espèce de perroquet en voie de disparition, originaire de Nouvelle-Zélande. C'est un animal inhabituel car c'est l'oiseau qui vit le plus longtemps au monde (peut vivre jusqu'à 90 ans). Pesant environ 3 à 4 kg, c'est aussi le perroquet le plus lourd, le seul incapable de voler et nocturne du monde. world.  

Les Kākāpō habitaient la Nouvelle-Zélande depuis leur évolution en seul mais leur population déclina rapidement. Dans les années 1970, seuls 18 kākāpō mâles existaient. L'existence de femelles Kākāpō a été confirmée en 1980. Grâce à une gestion intensive de la conservation, les perroquets Kākāpō ont été sortis du bord de l'extinction. Leur nombre était de 51 en 1995. Aujourd'hui, 247 kākāpō sont en vie.^1,2.  

Pour aider à la conservation, le projet Kākāpō125+ a vu le jour en 2015 pour séquencer les génomes de 125 kākāpō vivants ainsi que de quelques individus importants récemment décédés. L’idée était d’améliorer la gestion génétique du kākāpō, en particulier pour remédier au faible rendement reproducteur (infertilité) et aux maladies qui entravaient la guérison. L'assemblage complet au niveau des chromosomes du génome de référence d'un kākāpō individuel a été achevé en 2018.³.  

Dans une étude publiée le 29^th En août 2023, l'équipe de recherche a rapporté le séquençage des génomes de la quasi-totalité de la population de kākāpō (en 2018) de 169 kākāpō, à partir de 125 individus vivants et de 44 échantillons stockés. Les données au niveau de la population associent la diversité génétique de l'espèce à des séquences d'ADN spécifiques liées à des traits tels que la susceptibilité aux maladies, la croissance des poussins, etc. Cela pourrait aider à identifier plus tôt les risques pour la santé afin de planifier un traitement personnalisé pour chaque oiseau kākāpō. Cette approche visant à identifier des caractéristiques génétiques spécifiques cruciales à la survie pourrait être réutilisée pour gérer la conservation d'autres en voie de disparition espèce^4,5.  

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Références:  

1. Département de la Conservation. Gouvernement de la Nouvelle-Zélande. Récupération de Kākāpō. Disponible à  https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/ 

2. Musée d'histoire naturelle. Les kākāpō originaux de Nouvelle-Zélande sont sur le point de disparaître. https://www.nhm.ac.uk/discover/new-zealands-quirky-kakapo-are-pulled-back-from-extinction.html 

3. Département de la Conservation. Gouvernement de la Nouvelle-Zélande. Séquençage du gène Kākāpō125+ https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/what-we-do/research-for-the-future/kakapo125-gene-sequencing/ 

4. Université d'Otago 2023. Actualités – Sauver les espèces de l'extinction – le séquençage de haute qualité de la population de kākāpō constitue une avancée décisive dans la compréhension de la génétique clé de la conservation. Disponible à https://www.otago.ac.nz/news/otago0247128.html Consulté le 29 août 2023.  

5. Guhlin, J., Le Lec, MF, Wold, J. et al. La génomique à l’échelle de l’espèce du kākāpō fournit des outils pour accélérer le rétablissement. Nat Ecol Evol (2023). https://doi.org/10.1038/s41559-023-02165-y  Prépublication sur bioRxiv doi : https://doi.org/10.1101/2022.10.22.513130  

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