Des chercheurs ont découvert un nouvel archéon en symbiose au sein d'un système microbien marin. Ce génome présente une réduction extrême, avec un génome fortement réduit de seulement 238 kbp, et un biais fonctionnel extrême en faveur du traitement de l'information génétique. Son génome code principalement les mécanismes de réplication, de transcription et de traduction de l'ADN. Dépourvu de presque toutes les voies métaboliques, il présente une dépendance métabolique totale à l'hôte. Provisoirement nommé Candidatus Sukunaarchaeum mirabile, il s'agit essentiellement d'une entité cellulaire ne conservant que son noyau réplicatif et ayant évolué pour se rapprocher d'un mode de vie viral. Sukunaarchaeum mirabile apparaissant comme un lien entre les entités cellulaires et les virus, cette découverte nous amène à nous interroger sur les exigences minimales de la vie cellulaire.
Les dinoflagellés sont un groupe d'algues eucaryotes unicellulaires portant deux flagelles différents. Il s'agit principalement de plancton marin et sont connus pour maintenir des communautés microbiennes symbiotiques.
Dans une étude récente, l'amplification du génome unicellulaire de bactéries associées au dinoflagellé Citharistes regius ont révélé la présence d'une séquence circulaire très inhabituelle de 238 kbp, présentant une faible teneur en GC (guanine-cytosine) de 28.9 %. Cette séquence représentait le génome complet d'un procaryote. Une analyse plus approfondie a révélé que l'organisme porteur de ce génome est un archéon. À ce jour, le plus petit génome complet d'archée connu est celui de 490 kbp. Équitans de Nanoarchaeum. Le génome de l'archéon découvert lors de cette étude est deux fois moins grand, mais il s'avère très complet. Des investigations plus poussées ont confirmé qu'il s'agit bien d'un génome d'archéon complet et a été nommé ainsi. Candidatus Sukunaarchaeum mirabile.
L'archéon nouvellement découvert Environ Sukunaarchaeum mirabile Il présente une réduction génomique extrême, avec un génome fortement réduit de seulement 238 kbp (à titre de comparaison, la taille du génome des archées typiques est d'environ 0.5 à 5.8 Mbp, tandis que celle des virus varie de 2 kb à plus de 1 Mbp). De plus, il présente également un biais fonctionnel extrême en faveur du traitement de l'information génétique. Il code principalement les mécanismes de réplication, de transcription et de traduction de l'ADN. Il est dépourvu de presque toutes les voies métaboliques, ce qui lui confère une dépendance métabolique totale à l'hôte.
Environ Sukunaarchaeum mirabile ressemble aux virus par son génome minimal dédié à l'auto-perpétuation génétique et sa dépendance absolue à l'hôte, rendue nécessaire par la réduction métabolique. Cependant, contrairement aux virus, Sukunaarchaeum mirabile Il possède son propre appareil transcriptionnel et traductionnel, ainsi que ses propres ribosomes. Il ne manque pas de gènes de réplication et ne dépend pas de l'hôte pour cela. C'est la principale distinction entre les entités cellulaires et les virus. Sukunaarchaeum mirabile est fondamentalement une entité cellulaire ne conservant que son noyau réplicatif qui a évolué pour se rapprocher du mode d'existence viral.
Avec Sukunaarchaeum mirabile apparaissant comme un lien entre les entités cellulaires et les virus, cette découverte oblige à s'interroger sur les exigences minimales de la vie cellulaire.
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Références:
- Harada R., et al 2025. Une entité cellulaire ne conservant que son noyau réplicatif : lignée archéenne cachée au génome ultra-réduit. Prépublication sur bioRxiv. Soumise le 02 mai 2025. DOI : https://doi.org/10.1101/2025.05.02.651781
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