Des analyses et des études récentes ont suscité l'espoir de protéger l'humanité de la résistance aux antibiotiques, qui devient rapidement une menace mondiale.
La découverte des antibiotiques au milieu du XXe siècle a marqué une étape cruciale dans l'histoire de la médecine, offrant un traitement miraculeux contre de nombreuses infections bactériennes et maladies d'origine bactérienne . Autrefois qualifiés de « médicaments miracles », les antibiotiques sont aujourd'hui indispensables aux soins de santé de base comme aux soins médicaux de pointe, car ils ont véritablement transformé le monde en sauvant des vies et en devenant un élément essentiel du traitement de diverses affections médicales et de l'assistance lors d'interventions chirurgicales complexes.
La résistance aux antibiotiques augmente à un rythme rapide
Les antibiotiques sont des médicaments naturellement produits par des micro-organismes qui empêchent ou détruisent la croissance des bactéries . Leur importance est cruciale car les infections bactériennes ont toujours été un fléau pour l'humanité. Cependant, les bactéries résistantes développent des mécanismes de défense qui les protègent des effets des antibiotiques, alors qu'auparavant elles y étaient sensibles. Ces bactéries résistantes peuvent alors résister à toute attaque d'antibiotiques et, par conséquent, si elles sont responsables d'une maladie, les traitements classiques deviennent inefficaces, ce qui favorise la persistance de l'infection et sa propagation. Ainsi, les antibiotiques, autrefois considérés comme « miracles », commencent malheureusement à perdre de leur efficacité, ce qui représente une menace considérable pour les systèmes de santé du monde entier. Le nombre de bactéries résistantes est déjà responsable de plus de 500 000 décès chaque année et compromet l'efficacité des antibiotiques en matière de prévention et de traitement, constituant un tueur silencieux présent sous une forme ou une autre chez près de 60 % de la population mondiale. La résistance aux antibiotiques menace notre capacité à guérir de nombreuses maladies comme la tuberculose et la pneumonie, et à réaliser des progrès en chirurgie, dans le traitement du cancer, etc. On estime qu'environ 50 millions de personnes mourront d'infections résistantes aux antibiotiques d'ici 2050, et il est possible qu'un jour les antibiotiques ne puissent plus être utilisés pour traiter les infections graves comme ils le sont actuellement. Ce problème de résistance aux antibiotiques est devenu un enjeu de santé publique majeur qui exige une action urgente pour un avenir meilleur. La communauté médicale et scientifique, ainsi que les gouvernements du monde entier, prennent diverses mesures pour atteindre cet objectif.
Enquête de l'OMS : « l'ère post-antibiotique » ?
L’Organisation mondiale de la Santé (OMS) a déclaré la résistance aux antibiotiques comme une priorité absolue et un problème de santé publique majeur par le biais de son Système mondial de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (GLASS), lancé en octobre 2015. Ce système collecte, analyse et partage des données sur la résistance aux antibiotiques à l’échelle mondiale. En 2017, 52 pays (25 pays à revenu élevé, 20 pays à revenu intermédiaire et 1 pays à faible revenu) participaient au GLASS. Un premier rapport¹ contenant des informations sur les niveaux de résistance aux antibiotiques, fourni par 22 pays (un demi-million de participants à l’enquête), révèle une croissance alarmante, avec un taux de résistance global de 62 à 82 %. Cette initiative de l’OMS vise à sensibiliser l’opinion publique et à coordonner les efforts des différentes nations pour lutter contre ce grave problème à l’échelle mondiale.
Nous aurions pu empêcher la résistance aux antibiotiques et pouvons encore
Comment en sommes-nous arrivés à ce stade où la résistance aux antibiotiques est devenue une menace mondiale ? La réponse est simple : nous avons surutilisé et mal utilisé les antibiotiques . Ces dernières décennies, les médecins ont prescrit des antibiotiques à tous leurs patients, ou presque. De plus, dans de nombreux pays, notamment les pays en développement d’Asie et d’Afrique, les antibiotiques sont disponibles sans ordonnance en pharmacie. On estime que dans 50 % des cas, les antibiotiques sont prescrits pour des infections virales, alors qu’ils sont inefficaces, car le virus termine son cycle de vie (généralement de 3 à 10 jours), que les antibiotiques soient pris ou non. En réalité, l’efficacité des antibiotiques (qui ciblent les bactéries ) contre les virus reste un mystère pour beaucoup ! Les antibiotiques peuvent éventuellement soulager certains symptômes associés à l’infection virale. Même dans ce cas, leur utilisation demeure contraire à l’éthique médicale. Le conseil approprié serait que, puisqu'il n'existe aucun traitement pour la plupart des virus, l'infection devrait suivre son cours. À l'avenir, il conviendrait de prévenir ces infections en respectant une hygiène rigoureuse et en maintenant un environnement propre. Par ailleurs, les antibiotiques sont couramment utilisés pour accroître la production agricole mondiale et comme facteurs de croissance dans l'alimentation du bétail et des animaux destinés à la consommation (poulets, vaches, porcs). Ce faisant, l'homme s'expose également à un risque important d'ingestion de bactéries résistantes aux antibiotiques présentes dans ces aliments ou ces animaux, ce qui favorise la transmission de souches bactériennes résistantes au-delà des frontières.
Ce scénario est d'autant plus complexe qu'aucun nouvel antibiotique n'a été développé par les laboratoires pharmaceutiques ces dernières décennies – la dernière nouvelle classe d'antibiotiques contre les bactéries Gram négatif étant celle des quinolones, mise au point il y a quarante ans. Par conséquent, en l'état actuel des choses, il est illusoire d'envisager de prévenir la résistance aux antibiotiques en ajoutant des antibiotiques plus nombreux et différents, car cela ne ferait qu'aggraver le problème et favoriser la transmission des résistances. De nombreux laboratoires pharmaceutiques soulignent que le développement de tout nouveau médicament est, d'une part, très coûteux et long, car il exige des investissements considérables, et d'autre part, le profit potentiel des antibiotiques est généralement si faible que les entreprises peinent à atteindre le seuil de rentabilité. À cela s'ajoute le fait qu'une souche résistante à un nouvel antibiotique se développerait quelque part dans le monde dans les deux ans suivant sa mise sur le marché, faute de cadre légal pour limiter la surconsommation d'antibiotiques. Ce constat n'est guère encourageant, tant d'un point de vue commercial que médical, et le développement de nouveaux antibiotiques n'est donc pas la solution pour prévenir la résistance aux antibiotiques.
L’OMS recommande le plan d’action 2 pour prévenir la résistance aux antibiotiques :
a) Les professionnels et personnels de santé doivent procéder à une évaluation approfondie avant de prescrire des antibiotiques aux humains ou aux animaux. Une revue Cochrane portant sur différentes méthodes³ visant à réduire l’abus d’antibiotiques en milieu clinique a conclu à l’efficacité relative de la méthode de la « prescription de 3 jours ». Cette méthode consiste à informer le patient souffrant d’une infection (non bactérienne ) que son état s’améliorera dans les 3 jours, et qu’il peut prendre des antibiotiques si ses symptômes s’aggravent – ce qui est rare, l’infection virale ayant généralement suivi son cours à ce stade. b) Le grand public doit pouvoir poser des questions lors de la prescription d’antibiotiques et ne doit les prendre que s’il est absolument nécessaire. Il est également impératif de suivre le traitement prescrit dans son intégralité afin de prévenir la prolifération de souches bactériennes résistantes. c) Les agriculteurs et les éleveurs doivent utiliser les antibiotiques de manière réglementée et limitée , et uniquement lorsque cela est justifié (par exemple, pour traiter une infection). d) Les gouvernements doivent élaborer et appliquer des plans nationaux visant à limiter l’utilisation des antibiotiques¹ . Il convient de mettre en place des cadres adaptés aux besoins des pays développés et des pays à revenu intermédiaire et faible.
Maintenant que le mal est fait : lutter contre la résistance aux antibiotiques
Afin d'éviter un retour à l'ère pré-pénicilline (premier antibiotique découvert) et une nouvelle ère « post- antibiotiques », de nombreuses recherches sont menées dans ce domaine, marqué par des échecs et des succès ponctuels. Plusieurs études récentes proposent des pistes pour lutter contre la résistance aux antibiotiques et, potentiellement, l'inverser. La première, publiée dans le Journal of Antimicrobial Chemotherapy <sup>4 </sup>, montre que lorsque les bactéries deviennent résistantes, elles développent notamment une enzyme (une β-lactamase) qui détruit tout antibiotique tentant de pénétrer dans la cellule (à des fins thérapeutiques). Inhiber l'action de ces enzymes pourrait donc permettre d'enrayer la résistance aux antibiotiques. Dans une seconde étude, menée par la même équipe de l'Université de Bristol (Royaume-Uni) en collaboration avec l'Université d'Oxford et publiée dans Molecular Microbiology <sup>5 </sup>, les chercheurs ont analysé l'efficacité de deux types d'inhibiteurs de ces enzymes. Ces inhibiteurs (de la classe des boronates bicycliques) se sont révélés très efficaces sur un type particulier d'antibiotique (l'aztréonam) : en présence de cet inhibiteur, l'antibiotique était capable d'éliminer de nombreuses bactéries résistantes . Deux de ces inhibiteurs, l'avibactam et le vaborbactam, font actuellement l'objet d'essais cliniques et ont permis de sauver la vie d'une personne atteinte d'une infection incurable. Bien que les auteurs n'aient obtenu de résultats concluants qu'avec un type particulier d' antibiotique , leurs travaux suscitent l'espoir de freiner la progression de la résistance aux antibiotiques.
Dans une autre étude publiée dans Scientific Reports 6 , des chercheurs de l'Université de Montréal ont mis au point une approche novatrice pour bloquer le transfert de résistance entre bactéries, l'un des mécanismes de propagation de la résistance aux antibiotiques dans les hôpitaux et les établissements de santé. Les gènes responsables de la résistance bactérienne sont portés par des plasmides (petits fragments d'ADN capables de se répliquer indépendamment) qui se transfèrent d'une bactérie à l'autre, disséminant ainsi les bactéries résistantes . Les chercheurs ont criblé par modélisation informatique une bibliothèque de petites molécules chimiques capables de se lier à la protéine TraE, essentielle à ce transfert plasmidique. Le site de liaison de l'inhibiteur étant connu grâce à la structure moléculaire 3D de la protéine, les chercheurs ont observé qu'une fois les inhibiteurs potentiels liés à la protéine, le transfert des plasmides porteurs de gènes de résistance aux antibiotiques était significativement réduit. Cette découverte suggère une stratégie potentielle pour limiter et inverser la résistance aux antibiotiques. Cependant, ce type d'étude requiert la connaissance de la structure moléculaire 3D de la protéine, ce qui constitue une limitation, car de nombreuses protéines restent à caractériser. Néanmoins, l'idée est encourageante et de tels inhibiteurs pourraient jouer un rôle important dans les soins de santé courants.
La résistance aux antibiotiques menace et compromet plusieurs décennies d'améliorations et de progrès réalisés dans le domaine de la santé humaine , et le développement et la mise en œuvre de ces travaux auront un impact direct considérable sur la capacité des populations à vivre en bonne santé.
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Sources)
1. OMS. Rapport du Système mondial de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (GLASS). http://www.who.int/glass/resources/publications/early-implementation-report/en/ [Consulté le 29 janvier 2018].
2. OMS. Comment enrayer la résistance aux antibiotiques ? Voici les recommandations de l’OMS. http://www.who.int/mediacentre/commentaries/stop-antibiotic-resistance/en/ . [Consulté le 10 février 2018].
3. Arnold SR et Straus SE. 2005. Interventions visant à améliorer les pratiques de prescription d'antibiotiques en soins ambulatoires. Cochrane Database Syst Rev. 19(4). https://doi.org/10.1002/14651858.CD003539.pub2
4. Jiménez-Castellanos JC. et al. 2017. Modifications du protéome de l'enveloppe induites par la surexpression de RamA chez Klebsiella pneumoniae, renforçant la résistance acquise aux β-lactamines. Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 73(1) https://doi.org/10.1093/jac/dkx345
5. Calvopiña K. et al. 2017. Compréhension structurale et mécanistique de l'efficacité des inhibiteurs non classiques de β-lactamases contre des isolats cliniques de Stenotrophomonas maltophilia multirésistants. Molecular Microbiology. 106(3). https://doi.org/10.1111/mmi.13831
6. Casu B. et al. 2017. Le criblage par fragments identifie de nouvelles cibles pour les inhibiteurs du transfert conjugatif de la résistance aux antimicrobiens par le plasmide pKM101. Scientific Reports . 7(1). https://doi.org/10.1038/s41598-017-14953-1
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