Les antibiotiques actuellement utilisés dans la pratique clinique, en plus de neutraliser les agents pathogènes cibles, nuisent également aux bactéries saines de l'intestin. La perturbation du microbiome intestinal a des effets toxiques sur le foie, les reins et d’autres organes. C’est une question à résoudre. Des chercheurs ont découvert la lolamicine, un antibiotique candidat qui s'est révélé efficace contre les infections à Gram négatif sans affecter le microbiome intestinal sain lors d'études précliniques. C’est la preuve de concept que des antibiotiques qui tuent les microbes pathogènes tout en épargnant les bactéries bénéfiques dans l’intestin peuvent être développés pour les infections à Gram négatif. Cela offre un espoir de résoudre les problèmes associés au ciblage aveugle des bactéries à Gram négatif. Cependant, des années de recherche supplémentaires sont nécessaires avant d’atteindre le stade de l’utilisation clinique.
La plupart des antibiotiques ciblent soit uniquement les bactéries Gram-positives, soit les bactéries Gram-positives et Gram-négatives. Certains antibiotiques spécifiques aux bactéries Gram-négatives (ces dernières possèdent une double paroi cellulaire protectrice qui les rend difficiles à éliminer) détruisent également les bactéries Gram-négatives bénéfiques présentes dans l'intestin. Les perturbations du microbiote intestinal ainsi engendrées ont des effets toxiques, notamment sur le foie et les reins. D'où la nécessité de développer des antibiotiques capables d'éliminer sélectivement les bactéries pathogènes tout en préservant les bactéries bénéfiques. Comme le rapporte une étude récente, des scientifiques ont mis au point un tel antibiotique, la lolamicine, qui cible sélectivement les bactéries Gram-négatives pathogènes tout en épargnant les bactéries bénéfiques.
La lolamicine est un inhibiteur de la voie Lol (localisation des lipoprotéines), un système de transport des lipoprotéines que l'on trouve exclusivement dans les bactéries à Gram négatif et qui est génétiquement différent des bactéries pathogènes et bénéfiques.
En culture cellulaire, il n’a eu aucun effet appréciable sur les bactéries à Gram positif. À des doses plus élevées, il a neutralisé jusqu'à 90 % des isolats cliniques d'E. coli, de K. pneumoniae et d'E. cloacae multirésistants.
L'administration orale de lolamicine à des souris atteintes de septicémie ou de pneumonie résistante aux médicaments a sauvé 100 % des souris atteintes de septicémie et 70 % des souris atteintes de pneumonie. De plus, l’administration de lolamicine n’a entraîné aucun changement radical dans la composition taxonomique des bactéries dans le microbiome intestinal des souris au cours du traitement de trois jours ou des 28 jours de récupération suivants.
Ces résultats d'études précliniques sur des animaux sont encourageants et offrent l'espoir de résoudre les problèmes liés au ciblage non sélectif des bactéries Gram négatif. Ils constituent une preuve de concept démontrant qu'il est possible de développer des antibiotiques ciblant sélectivement les bactéries Gram négatif pathogènes tout en préservant le microbiote intestinal de tout effet indésirable. Toutefois, des années de recherche supplémentaires sont nécessaires pour confirmer ces résultats.
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Références:
- Muñoz, KA, Ulrich, RJ, Vasan, AK et al. Un antibiotique sélectif à Gram négatif qui épargne le microbiome intestinal. Nature 630, 429-436 (2024). Publié : 29 mai 2024. DOI : https://doi.org/10.1038/s41586-024-07502-0
- Université de l'Illinois Urbana-Champaign 2024. Actualités de la recherche – Un nouvel antibiotique tue les bactéries pathogènes et épargne les microbes intestinaux sains. Publié le 29 mai 2024. Disponible sur https://news.illinois.edu/view/6367/668002791
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