Les scientifiques ont identifié plusieurs groupes de bactéries qui variaient selon la dépression et la qualité de vie chez l'homme
Notre système digestif abrite des milliards de micro-organismes. Les microbes qui y résident remplissent des fonctions essentielles et influencent notre santé, notamment en ayant un impact sur des maladies comme l'obésité, le diabète et le cancer. Grâce à une meilleure compréhension de cette influence aux niveaux cellulaire et moléculaire, il apparaît qu'un déséquilibre de la flore intestinale peut entraîner une réaction excessive du système immunitaire et contribuer à l'inflammation du tube digestif. Ceci peut engendrer diverses maladies dans tout le corps. Dans deux études récentes <sup>1,2</sup> , des chercheurs ont séquencé l'ADN de plus de 100 nouvelles espèces de microbes intestinaux, constituant ainsi la liste la plus complète de la flore intestinale humaine à ce jour. Cette liste peut être utilisée pour des recherches approfondies sur les effets des différentes bactéries intestinales sur la santé humaine.
Découvrir le lien entre les microbes intestinaux et la santé mentale
La communauté scientifique s'intéresse au lien possible entre le métabolisme du microbiote intestinal et la santé mentale et le bien-être. Il est intéressant de noter que les métabolites microbiens pourraient interagir avec notre cerveau et influencer nos émotions ou nos comportements en jouant un rôle dans le système nerveux. Cette association a été étudiée chez l'animal, mais pas suffisamment chez l'humain. Dans une étude de population inédite³ publiée dans Nature Microbiology , des scientifiques ont cherché à élucider la nature exacte de la relation entre les bactéries intestinales présentes dans le tube digestif humain et la santé mentale, en rassemblant des preuves que ces bactéries peuvent produire des composés neuroactifs. Ils ont combiné des données sur le microbiome fécal avec les dossiers de diagnostic de dépression de 3 1100 personnes participant au projet flamand sur la flore intestinale. Le bien-être mental a été évalué par différents moyens, notamment des tests médicaux, des diagnostics médicaux et l'auto-évaluation des participants. L'analyse de ces données a permis d'identifier les micro-organismes susceptibles d'avoir un impact positif ou négatif sur la santé mentale.
Ils ont montré que deux groupes bactériens, Coprococcus et Dialister, étaient constamment présents en faible quantité chez les personnes souffrant de dépression, qu'elles prennent ou non des antidépresseurs. En revanche, Faecalibacterium et Coprococcus étaient fréquemment présents chez les personnes présentant une meilleure qualité de vie et une meilleure santé mentale. Ces résultats ont été validés par deux études de cohorte indépendantes : la première portait sur 1 063 personnes issues de l'étude néerlandaise LifeLinesDEEP, et la seconde était une étude menée auprès de patients des Cliniques universitaires de Louvain, en Belgique, ayant reçu un diagnostic clinique de dépression. Une des observations a révélé que ces micro-organismes pouvaient produire du DOPAC, un métabolite de neurotransmetteurs humains comme la dopamine et la sérotonine, connus pour interagir avec le cerveau et être associés à une meilleure qualité de vie et de santé mentale.
Analyse computationnelle
Une technique de bioinformatique a été mise au point pour identifier précisément les bactéries intestinales interagissant avec le système nerveux humain. Les chercheurs ont utilisé les génomes de plus de 500 bactéries afin d'étudier leur capacité à produire des composés neuroactifs dans l'intestin. Il s'agit du premier catalogue exhaustif de la neuroactivité intestinale, qui contribue à approfondir notre compréhension du rôle des microbes intestinaux dans la production, la dégradation et la modification des molécules. Bien que les résultats informatiques nécessitent des validations pour confirmer ces affirmations, ils enrichissent notre compréhension des interactions entre le microbiome humain et le cerveau.
Au début de leur étude, les chercheurs supposaient que la santé mentale influençait les micro-organismes intestinaux, et non l'inverse. Or, cette étude a démontré que les microbes intestinaux interagissent avec notre système nerveux en produisant des neurotransmetteurs essentiels à une bonne santé mentale. Il est important de noter que les micro-organismes présents hors de notre corps, par exemple dans l'environnement, sont incapables de produire des neurotransmetteurs similaires ; il est donc possible que les microbes intestinaux aient évolué pour agir sur ce sujet. Cette étude, la première d'envergure menée auprès d'individus vivant dans diverses régions géographiques, suggère que l'approche clinique de la santé mentale pourrait intégrer les probiotiques comme nouvelle méthode de traitement pour stimuler la flore intestinale bénéfique. L'étude doit d'abord être validée sur des modèles animaux : des bactéries spécifiques seraient cultivées et le comportement des animaux analysé. Si des liens solides sont établis, des essais cliniques chez l'humain pourraient être envisagés.
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Sources)
1. Zou Y et al. 2019. 1520 génomes de référence de bactéries intestinales humaines cultivées permettent des analyses fonctionnelles du microbiome. Nature Biotechnology . 37. https://doi.org/10.1038/s41587-018-0008-8
2. Forster SC et al. 2019. Un génome bactérien intestinal humain et une collection de cultures pour des analyses métagénomiques améliorées. Nature Biotechnology . 37. https://doi.org/10.1038/s41587-018-0009-7
3. Valles-Colomer M et al. 2019. Le potentiel neuroactif du microbiote intestinal humain sur la qualité de vie et la dépression. Nature Microbiology . https://doi.org/10.1038/s41564-018-0337-xac
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