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Human Proteome Project (HPP) : plan couvrant 90.4 % du protéome humain libéré

LES SCIENCESLA BIOLOGIEHuman Proteome Project (HPP) : plan couvrant 90.4 % du protéome humain libéré

Human Proteome Project (HPP) a été lancé en 2010 après l'achèvement réussi du Human Genome Project (HGP) pour identifier, caractériser et cartographier le protéome humain (l'ensemble des protéines exprimées par le génome humain). À l'occasion de son dixième anniversaire, HPP a publié le premier schéma directeur à haute stringence qui couvre 90.4 % du protéome humain. En tant que code de la vie, cette étape a des implications très importantes pour la santé humaine et la thérapeutique.   

Achevé en 2003, Human Genome Project (HGP) était une collaboration internationale mise en place en 1990 dans le but d'identifier l'ensemble complet des gènes humains et de déterminer la séquence complète des bases d'ADN dans le génome humain. Le 15 janvier 2001, HGP avait publié la séquence initiale et l'analyse du génome humain. L'identification, la caractérisation et la cartographie du protéome humain (tout le complément des protéines codées par le génome) était la prochaine étape logique. Par conséquent, la Human Proteome Organization (HUPO) a été formée le 9 février 2001 pour promouvoir la recherche en protéomique. Le 23 septembre 2010, HUPO a officiellement lancé le Human Proteome Project (HPP) dans le but de préparer un plan directeur du protéome humain (1).  

L'analyse de l'humain génome prédit environ 20,300 2010 gènes codant pour des protéines. L'ensemble des protéines codées par ces gènes constitue le « protéome humain ». Le protéome humain est beaucoup plus volumineux que le « génome humain » car un gène peut être exprimé sous diverses formes (protéoformes) à la suite de modifications chimiques pendant et après la traduction. On estime qu'un million de protéoformes peuvent coexister chez un même individu. En 70, au démarrage de l'HPP, à peine XNUMX % des protéines prédites par l'analyse du génome ont été identifiées. L'agenda du projet protéome était de combler ce manque de connaissances. Avec les progrès technologiques, il est devenu possible de détecter et de quantifier les protéines et leurs formes avec une plus grande précision. Pourtant, il y a un bon nombre de protéines manquantes (protéines prédit par l'analyse du génome, mais toujours non détecté) (2,3). Le projet est toujours en cours; cependant, une étape a été franchie. 

Le 16 octobre 2020, à l'occasion de son dixième anniversaire, HPP a publié le premier schéma directeur à haute stringence qui couvre 90.4 % du protéome humain (1). Cela améliore considérablement notre connaissance de la biologie humaine et la compréhension des mécanismes moléculaires au niveau cellulaire et moléculaire, en particulier le rôle joué par le protéome humain qui conduit directement à la recherche et au développement de diagnostics et de thérapeutiques pour les cancers, les maladies cardiovasculaires et infectieuses en particulier pour personnaliser et médecine de précision (4)

Le développement de l'humain Protéines Atlas présente un progrès très important pour la poursuite des recherches dans le domaine du diagnostic et de la thérapeutique chez l'homme (5,6).  

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Références:

  1. HUPO 2021. Chronologie de la protéomique. Disponible sur https://hupo.org/Proteomics-Timeline.  
  1. neXtProt 2021. Le protéome humain. Disponible en ligne sur https://www.nextprot.org/about/human-proteome Consulté le 30 décembre 2020. 
  1. Inserm, 2020. Protéomique : le code du vivant traduit à plus de 90 %. Publié le 07 décembre 2020. Disponible en ligne sur https://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/proteomique-code-vie-traduit-plus-90 Consulté le 30 décembre 2020.  
  1. Adhikari, S., Nice, EC, Deutsch, EW et al. 2020. Un plan de haute stringence du protéome humain. Publication : 16 octobre 2020. Nature Communication 11, 5301 (2020). EST CE QUE JE: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9  
  1. Digre A. et Lindskog C., 2020. The Human Protein Atlas – Localisation spatiale du protéome humain dans la santé et la maladie. Protein Science Volume 30, Issue 1. Première publication : 04 novembre 2020. DOI : https://doi.org/10.1002/pro.3987  
  1. L'Atlas des protéines humaines 2020. Atlas des protéines humaines Disponible en ligne sur https://www.proteinatlas.org/about Consulté le 30 décembre 2020. 

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Umesh Prasad
Umesh Prasad
Rédacteur en chef, Scientific European

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