Des cas de co-infections avec deux variantes ont été signalés plus tôt. On ne savait pas grand-chose sur la recombinaison virale produisant des virus avec des génomes hybrides. Deux études récentes rapportent des cas de recombinaison génétique entre les variants du SARS-CoV-2 Denta & Omicron. Le recombinant, appelé Deltamicron, présentait les caractéristiques des deux variantes.
Le terme 'deltacron' est apparu au début de cette année1 pour désigner les cas de co-infection COVID-19 de personnes avec les différentes variantes des variantes du SRAS-Cov-2, par exemple delta et omicron. Delmicron ou Deltacron faisaient référence à l'infection causée par une combinaison de "deux variantes de la même souche de virus, le SRAS CoV-2", et n'étaient pas considérées comme des "souches" différentes.
Cependant, des cas de recombinaison génétique entre deux souches différentes de SARA-CoV-2 ont été rapportés récemment. Le 08 mars 2022, des chercheurs2 ont signalé trois infections dans le sud de la France avec le « deltamicron » recombinant avec un génome hybride contenant une protéine de pointe d'une variante d'Omicron et le « corps » d'une variante de Delta. Le génome hybride avait des mutations de signature des deux lignées. La pointe recombinante pourrait optimiser la liaison virale à la membrane de la cellule hôte.
Des preuves de la recombinaison Delta et Omicron ont émergé des États-Unis3 ainsi que. Cette équipe a pu identifier deux cas indépendants de Delta-Omicron recombinant. Dans les deux cas, l'extrémité 5' du génome viral provenait du génome Delta et l'extrémité 3' d'Omicron.
Il est suggéré que les virus recombinants ne sont pas courants et il n'y a aucune preuve suggérant que les recombinants avec des génomes hybrides sont plus transmissibles ou virulents que les variantes dominantes en circulation.
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Références:
- Deltacron n'est pas une nouvelle souche ou une variante. Scientifique Européen. Publié le 9 janvier 2022. Disponible sur https://www.scientificeuropean.co.uk/covid-19/deltacron-is-not-a-new-strain-or-variant/
- Colson, P., et al 2022. Culture et identification d'un SRAS-CoV-2 "deltamicron" dans un cluster de trois cas dans le sud de la France. Prétirage medRxiv. Publié le 08 mars 2022. DOI : https://doi.org/10.1101/2022.03.03.22271812
- Bolzé A., et al 2022. Preuve des co-infections et recombinaisons SARS-CoV-2 Delta et Omicron. Prétirage medRxiv. Publié le 12 mars 2022. DOI : https://doi.org/10.1101/2022.03.09.22272113
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