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Paride : un nouveau virus (bactériophage) qui combat les bactéries dormantes tolérantes aux antibiotiques  

La dormance bactérienne est une stratégie de survie en réponse à une exposition stressante aux antibiotiques pris par un patient à des fins de traitement. Les cellules dormantes deviennent tolérantes aux antibiotiques, sont tuées plus lentement et survivent parfois. C'est ce qu'on appelle la « tolérance aux antibiotiques », contrairement à la résistance aux antibiotiques lorsque les bactéries se développent en présence d'antibiotiques. Les infections chroniques ou récurrentes sont attribuées à la tolérance aux antibiotiques, pour laquelle il n’existe aucun traitement efficace. La phagothérapie est envisagée depuis longtemps, mais les cellules bactériennes dormantes ne répondent pas et sont réfractaires aux bactériophages connus. Des scientifiques de l'ETH Zurich ont identifié un nouveau bactériophage qui se réplique de manière unique sur des cultures profondes en phase stationnaire de Pseudomonas aeruginosa. Nommé « Paride », ce bactériophage pourrait tuer P. aeruginosa en dormance profonde par réplication lytique directe. Il est intéressant de noter que ce nouveau phage a réduit la charge bactérienne grâce à la synergie phage-antibiotique lorsque l’antibiotique méropénème a été ajouté aux cultures. Apparemment, le nouveau phage pourrait exploiter les points faibles de la physiologie des bactéries dormantes pour surmonter la tolérance aux antibiotiques. Ces points faibles pourraient être les cibles d’un nouveau traitement contre les infections chroniques causées par des bactéries dormantes ou inactives.    

La plupart des bactéries sur Terre sont dans un état dormant d’activité métabolique réduite ou sous forme de spores complètement inactives. Ces cellules bactériennes peuvent être facilement réanimées lorsque les nutriments et les molécules nécessaires deviennent disponibles.  

La dormance ou l'inactivité bactérienne est la stratégie de survie en réponse à des conditions environnementales externes stressantes comme la famine ou l'exposition aux antibiotiques pris par un patient à des fins de traitement. Dans un cas ultérieur, les cellules dormantes deviennent tolérantes aux antibiotiques parce que les processus cellulaires ciblés par les antibiotiques pour tuer les bactéries sont désactivés. Ce phénomène est appelé 'tolérance aux antibiotiques" auquel cas les bactéries sont tuées plus lentement et survivent parfois (contrairement à ce qui se passe dans le cas de résistance aux antibiotiques lorsque les bactéries se développent en présence d'antibiotiques). Les infections chroniques ou récurrentes sont attribuées à des cellules bactériennes dormantes tolérantes aux antibiotiques, souvent appelées « persistantes », pour lesquelles il n’existe aucun traitement efficace.  

La thérapie phagique impliquant des bactériophages ou des phages (c'est-à-dire des virus antérieurs aux bactéries) a longtemps été envisagée pour traiter les infections chroniques causées par des bactéries dormantes ou inactives. Toutefois, cette approche fonctionne lorsque les cellules bactériennes de l'hôte sont en croissance. Les cellules bactériennes dormantes ou inactives, cependant, ne répondent pas et sont réfractaires aux bactériophages qui soit évitent l'adsorption sur les surfaces des cellules bactériennes, soit hibernent dans les cellules dormantes jusqu'à la réanimation.  

Les bactériophages connus n’ont pas la capacité d’infecter les bactéries tolérantes aux antibiotiques, profondément dormantes ou inactives. On pensait qu’étant donné la diversité, des phages capables d’infecter les cellules dormantes pourraient exister dans la nature. Les chercheurs ont identifié pour la première fois un tel nouveau bactériophage.  

Dans une étude récemment publiée, des scientifiques de ETH Zurich rapportent l'isolement d'un nouveau bactériophage qui se réplique de manière unique sur des cultures profondes en phase stationnaire de Pseudomonas aeruginosa dans le laboratoire. Ils ont nommé ce bactériophage Paride. Ce phage pourrait tuer en dormance profonde P. aeruginosa par réplication lytique directe. Il est intéressant de noter que ce nouveau phage a réduit la charge bactérienne grâce à la synergie phage-antibiotique lorsque l'antibiotique méropénème a été ajouté à P. aeruginosa-cultures de phages.  

Apparemment, le nouveau phage pourrait exploiter les points faibles de la physiologie des bactéries dormantes pour surmonter la tolérance aux antibiotiques. Ces points faibles pourraient être les cibles d’un nouveau traitement contre les infections chroniques causées par des bactéries dormantes ou inactives.  

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Référence:  

  1. Maffei, E., Woischnig, AK., Burkolter, MR et al. Le phage Paride peut tuer les cellules dormantes et tolérantes aux antibiotiques de Pseudomonas aeruginosa par réplication lytique directe. Nat Commun 15, 175 (2024). https://doi.org/10.1038/s41467-023-44157-3 

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Umesh Prasad
Umesh Prasad
Journaliste scientifique | Rédacteur fondateur, magazine Scientific European

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